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张健

职称/职务:英才副教授、特聘研究员
办公室:医工院办公楼107室
邮箱:jian_zhang@tju.edu.cn

个人简介:

张健,理学博士,现任天津大学医学院英才副教授、特聘研究员,博士生导师。本科毕业于南开大学计算机科学与技术专业,博士毕业于军事医学研究院生物信息学专业(美国哈佛大学联合培养)。研究方向聚焦于生物医学大数据深度挖掘与智能解析研究,旨在通过开发先进的生物信息学及人工智能技术,推动重大疾病的精准诊断及个性化治疗。近年来以第一/通讯(含共同)作者身份在Nature Biotechnology (2018), Nature Genetics (2019), Genome Medicine (2019), Journal for ImmunoTherapy of Cancer (2022)Cell Stem Cell (2022), Cell Reports Methods (2023) 等业内权威学术期刊发表论文十余篇,研究成果先后被Nature, Cell, Nature Reviews Cancer, Nature Reviews Immunology等杂志引用,入选美国癌症研究协会年度主会议报告以及国际抗体研究联盟邀请报告。主持国家重点研究计划课题、国家自然科学基金面上、青年项目,天津市应用基础研究医学+”专项基金,担任中国自动化学会智能健康与生物信息专委会委员、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员。

 

主要研究方向:

机器学习与人工智能、生物信息与计算生物学

(欢迎对AI for Life Sciences感兴趣的本科生、硕士生和博士生加入,共同探索人工智能如何驱动生物医学的前沿突破!我们的研究涵盖大数据驱动的免疫药物智能设计、单细胞与时空组学数据深度解析、神经科学启发的下一代人工智能方法等领域。)

 

代表性学术成果:

1.  K.Wang, L.Cai, H.Wang, S.Shan, X.Hu, J. Zhang*, Fast clonal family inference from large-scale B cell repertoire sequencing data, STAR Protocols, 2024

2.   K.Wang, X.Hu, J. Zhang*, Fast clonal family inference from large-scale B cell repertoire sequencing data, Cell Reports Methods, 2023

3.   J.Qin#, J.Zhang#, J.Jiang#, B.Zhang, J.Li, X.Lin, S.Wang, M.Zhu, Z.Fan, Y.Lv, L.He, L.Chen, W.Yue, Y.Li*, X.Pei*. Direct chemical reprogramming of human cord blood erythroblasts to induced megakaryocytes that produce platelets. Cell Stem Cell, 2022

4.  X.Xing#, J.Shi#, Y.Jia#, Y.Dou#, Z.Li#, B.Dong, T.Guo, X.Cheng, X.Li, H.Du, Y.Hu, S.Jia*, J.Zhang*, Z.Li*, J.Ji*. Effect of neoadjuvant chemotherapy on the immune microenvironment in gastric cancer as determined by multiplex immunofluorescence and T cell receptor repertoire analysis. Journal for ImmunoTherapy of Cancer, 2022

5.   H. Wang#, C. Feng#, M. Lu, B. Zhang, Y. Xu, Q. Zeng, J. Xi, J. Zhou, X. Ying, J. Zhang*, W. Yue*, X. Pei*. Integrative single-cell transcriptome analysis reveals a subpopulation of fibroblasts associated with favorable prognosis of liver cancer patients. Translational Oncology, 2021

6.   H. Zhang, L. Liu, J. Zhang, J. Chen, J. Ye, S. Shukla, J. Qiao, X. Zhan, H. Chen, C. Wu, Y. Fu, B. Li, Investigation of Antigen-Specific T-Cell Receptor Clusters in Human Cancers, Clinical Cancer Research, 2020

7.  X. Hu#, J. Zhang#, J. Wang, J. Fu, T. Li, X. Zheng, B. Wang, S. Gu, P. Jiang, J. Fan, X. Ying, J. Zhang, M.C. Carroll, K.W. Wucherpfennig, N. Hacohen, F. Zhang, P. Zhang, J.S. Liu*, B. Li*, X.S. Liu*, Landscape of B cell immunity and related immune evasion in human cancers, Nature Genetics, 2019

8.  J. Zhang, X. Hu, J. Wang, A. Das Sahu, D. Cohen, J. Fan, B. Wang, J. Fu, S. Gu, M. Sade-Feldman, N. Hacohen, W. Li, X. Ying, B. Li, X.S. Liu, Immune receptor repertoires in pediatric and adult acute myeloid leukemia, Genome Medicine, 2019.

9.  X. Hu#, J. Zhang#, J.S. Liu, B. Li*, X.S. Liu*, Evaluation of immune repertoire inference methods from RNA-seq data, Nature Biotechnology. 2018

10. B. Li, T. Li, B. Wang, R. Dou, J. Zhang, J.S. Liu, X.S. Liu, Ultrasensitive detection of TCR hypervariable-region sequences in solid-tissue RNA-seq data, Nature Genetics. 2017

 

科研项目:

1.     2025-2028 国家自然科学基金面上项目 50万元 项目负责人

2.     2024-2027 天津市应用基础研究项项目重点 20万元 合作负责人

3.     2023-2026 国家重点研发计划380万元 课题负责人

4.     2023-2024 横向项目 20万元 项目负责人

5.     2022-2024 天津市应用基础研究项青年项目 6万元 合作负责人

6.     2021-2023 国家自然科学基金青年项目 30万元 项目负责人

7.     2020-2021 天津大学自主创新基金 13万元 项目负责人

8.     2020-2023 国家自然科学基金委面上项目 58万元 参与

9.     2018-2020 国家科技重大专项,2258.91万 参与

 

获奖情况:

2023年 天津大学本科毕业设计(论文)优秀指导教师

2021年 天津大学医学部教书育人优秀奖

2020年 入选天津大学-北洋学者英才计划

2016年 国家留学基金委公派留学基金资助

2014年 第五届中美临床与转化医学国际论坛研究生论文奖

 

社会学术兼职:

中国自动化学会智能健康与生物信息专委会委员

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员